Al piano terra sono conservati i resti più grandi del Museo: sculture dei governatori, rappresentazioni di vari rituali religiosi e miti interessanti, le parti migliori dei famosi monumenti di Mérida, i segreti dei loro giochi gladiatori e le elaborate produzioni teatrali. Al primo piano attendono, in notevole stato di conservazione, gli oggetti della vita quotidiana: oggetti della cucina, dell'ufficio, della nursery e del camerino delle signore, tutti portatori di curiose tradizioni. Nel Secondo Piano, gli abitanti della vecchia Mérida ci ricontattano attraverso messaggi in mosaici giganteschi e minuscole tavolette. Ci raccontano da dove vengono, le loro colorate professioni, le loro storie d’amore e tragedie, e le loro tante avventure di due millenni fa. Infine, nella Cripta, accompagnati dalla Guida, i clienti potranno visitare uno scavo archeologico vivente proprio sotto i piedi della città romana meglio conservata di Spagna.