Il Cenote Esmeralda è un gioiello naturale situato all'interno della laguna di Bacalar. Il suo nome deriva dall'intenso colore verde smeraldo che lo caratterizza, risultato della miscela di minerali e correnti d'acqua sotterranee che emergono in questa zona. Si tratta di un punto di grande profondità che crea un contrasto sorprendente con le acque turchesi che lo circondano. Durante le escursioni in barca, si fa una sosta per ammirare la sua bellezza e conoscere la sua importanza ecologica, poiché qui si trova una delle bocche d'acqua che alimentano la laguna. Tuttavia, per motivi di sicurezza e conservazione, in questo sito non è consentito nuotare. La visita si limita all'osservazione dalla barca.

Il Cenote Cocalitos, noto come "Santuario delle Stromatoliti", è uno dei gioielli naturali più emblematici di Bacalar. Le acque poco profonde e cristalline consentono di osservare da vicino queste antiche formazioni, considerate i più antichi organismi viventi del pianeta. Tuttavia, a causa della loro fragilità e per preservare questo ecosistema unico, è vietato nuotare nelle aree in cui si trovano le stromatoliti. Per questo motivo, durante i tour in barca della Laguna dei Sette Colori, Cocalitos è una tappa da ammirare dalla barca, senza la possibilità di entrare in acqua in quella specifica zona. Questa misura mira a proteggere e conservare questo tesoro naturale per le generazioni future.

A pochi metri dal Cenote Cocalitos, i tour in barca si fermano in una zona bassa e cristallina della laguna di Bacalar, ideale per nuotare e rilassarsi. Questo luogo di balneazione si distingue per le sue acque poco profonde, il fondo sabbioso e il caratteristico colore turchese che dà il nome alla Laguna dei Sette Colori. È un luogo sicuro e perfetto per immergersi, galleggiare o semplicemente godersi il paesaggio. A differenza di altri punti più profondi o delicati, qui è consentito nuotare, il che rende questo uno dei momenti più attesi del tour.

L'Isla de los Pájaros è una piccola isola situata all'interno della Laguna di Bacalar, nota per essere un santuario naturale dove vivono e nidificano diverse specie di uccelli, come aironi, spatole rosate e cormorani. La sua fitta vegetazione e la sua tranquillità ne fanno un luogo chiave per il birdwatching e la contemplazione dell'ecosistema locale. Durante i tour in barca, si fa una sosta davanti all'isola per ammirarla dalla barca, poiché per motivi di conservazione non è consentito scendere o nuotare in questa zona. È un'area protetta che mette in evidenza la ricchezza naturale di Bacalar.

Il Canal de los Piratas è una delle destinazioni più emblematiche di Bacalar, Quintana Roo. Questo canale naturale collega la laguna di Bacalar con il fiume Hondo e deve il suo nome alle storie dei corsari che, in epoca coloniale, utilizzavano questa via per saccheggiare la regione. Durante i tour in barca, si naviga attraverso il canale, permettendo ai visitatori di apprezzare le sue acque turchesi e cristalline e il fondo sabbioso. Una volta arrivati al sito, c'è una fermata in cui si può scendere dalla barca per nuotare e godersi i dintorni. Le acque poco profonde e la corrente leggera lo rendono un luogo ideale per rilassarsi.