La chiesa di San Pietro a Melaka è la più antica chiesa cattolica romana funzionante in Malesia. Dal 1511 al 1641, mentre sotto il dominio portoghese, Malacca fu descritta come una città cristiana con una chiesa o cappella cattolica in ogni strada. Nel 1618, c'erano 7.400 cristiani a Malacca con 14 chiese e due cappelle. Nel 1641, Malacca cadde sugli olandesi che, essendo prevalentemente protestanti e anticattolici, iniziarono a demolire chiese portoghesi e perseguitare la popolazione cattolica della città. Ai sacerdoti era proibito predicare. Cosa deve aver pensato qui la popolazione malese locale a questi due gruppi di europei che erano così cattivi l'uno con l'altro nonostante fossero estranei in una terra straniera così lontana da casa, ed entrambi professano di appartenere a una cultura superiore? Durante la guerra di successione spagnola (1701-1714), l'Olanda e il Portogallo si ritrovarono a combattere dalla stessa parte della Grande Alleanza. Di conseguenza gli olandesi diminuirono la persecuzione dei cattolici a Malacca e un cattolico olandese di nome Franz Amboer ottenne il permesso di donare terreni per la costruzione della chiesa di San Pietro che, come suggerisce la data sul campanile, fu terminata intorno al 1710.